Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms