Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms