Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Colec11Q3SXB8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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