Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Fam178bQ24JP3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Fam178bQ24JP3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Fam178bQ24JP3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Fam178bQ24JP3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Fam178bQ24JP3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Fam178bQ24JP3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Fam178bQ24JP3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Fam178bQ24JP3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam178bQ24JP3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms