Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms