Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms