Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klrb1Q0ZUP1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klrb1Q0ZUP1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms