Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms