Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms