Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisal1Q0VBP7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisal1Q0VBP7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms