Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spata18Q0P557 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spata18Q0P557 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spata18Q0P557 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms