Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms