Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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