Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms