Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg2Q03517 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms