Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RykQ01887 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RykQ01887 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RykQ01887 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RykQ01887 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RykQ01887 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RykQ01887 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RykQ01887 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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