Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Hoxd1Q01822 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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