Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms