Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms