Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms