Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited1P97769 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms