Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms