Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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