Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms