Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms