Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Atp5eP56382 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms