Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacnb3P54285 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms