Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a1P51906 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms