Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TubP50586 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TubP50586 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TubP50586 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms