Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf7P43029 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf7P43029 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf7P43029 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf7P43029 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf7P43029 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf7P43029 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf7P43029 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf7P43029 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf7P43029 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf7P43029 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf7P43029 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf7P43029 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf7P43029 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf7P43029 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf7P43029 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms