Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms