Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrbP28704 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxrbP28704 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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