Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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