Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms