Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms