Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms