Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms