Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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