Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prf1P10820 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prf1P10820 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms