Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms