Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BlmO88700 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BlmO88700 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BlmO88700 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms