Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms