Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfdp1O88271 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms