Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgceO70258 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgceO70258 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgceO70258 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgceO70258 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgceO70258 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgceO70258 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgceO70258 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgceO70258 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgceO70258 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgceO70258 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgceO70258 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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