Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek2O35942 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek2O35942 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms