Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Bnc1O35914 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Bnc1O35914 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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