Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl25O35903 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms