Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Timm44O35857 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm44O35857 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms