Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PbsnO08976 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PbsnO08976 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PbsnO08976 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms