Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp35M0QWN7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms